87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3315 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3315  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83082  normal  0.599148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3831  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.539928 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2148  hypothetical protein  98.89 
 
 		 90 aa  174  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3938  hypothetical protein  96.67 
 
 		 90 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3590  hypothetical protein  96.67 
 
 		 90 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.068021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4429  hypothetical protein  96.67 
 
 		 90 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.731953  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4644  hypothetical protein  95.56 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.957845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2330  TPR repeat-containing protein  85.56 
 
 		 90 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2468  TPR repeat-containing protein  85.56 
 
 		 90 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113505  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0664  TPR repeat-containing protein  85.56 
 
 		 90 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292357  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0789  TPR repeat-containing protein  85.56 
 
 		 90 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0308696  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1625  hypothetical protein  84.44 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0433858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1745  hypothetical protein  84.44 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565247  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1833  hypothetical protein  84.44 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0385386  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0503  TPR repeat-containing protein  84.44 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245858  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4365  hypothetical protein  83.33 
 
 		 90 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2891  hypothetical protein  82.22 
 
 		 90 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5590  hypothetical protein  81.11 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.678134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6852  protein of unknown function DUF339  81.11 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.493884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2147  protein of unknown function DUF339  75.58 
 
 		 95 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1823  protein of unknown function DUF339  75.58 
 
 		 95 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0813209  normal  0.601393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1992  hypothetical protein  75.58 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10824  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2482  hypothetical protein  70.93 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2321  hypothetical protein  69.77 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2423  hypothetical protein  54.32 
 
 		 99 aa  87  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1797  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.908187  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1059  protein of unknown function DUF339  50 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.621454  normal  0.0453612 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0762  hypothetical protein  48.72 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2702  hypothetical protein  58.67 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00765809 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2166  hypothetical protein  51.85 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1426  protein of unknown function DUF339  52.63 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2200  hypothetical protein  51.32 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.521677  normal  0.894943 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2287  protein of unknown function DUF339  55.26 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2797  hypothetical protein  55.26 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1336  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.401477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  37.31 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2939  hypothetical protein  32.89 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.427354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2857  hypothetical protein  32.89 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3036  hypothetical protein  63.33 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1876  protein of unknown function DUF339  41.07 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  36 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1150  hypothetical protein  36.51 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225025  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1186  hypothetical protein  36.84 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.990157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3121  protein of unknown function DUF339  35.19 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0704763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3604  hypothetical protein  56.67 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  38.1 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1269  hypothetical protein  35.19 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1139  hypothetical protein  33.33 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  34.33 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1236  hypothetical protein  35.19 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1339  hypothetical protein  32.89 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1192  hypothetical protein  35.19 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  37.18 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2265  hypothetical protein  29.21 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  37.18 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  37.18 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1045  hypothetical protein  35 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.453082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2775  hypothetical protein  38.1 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3035  hypothetical protein  36.51 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.380295 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  34.33 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2938  hypothetical protein  35.09 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1358  hypothetical protein  32.88 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2254  response regulator receiver domain-containing protein  30.67 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00897791  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.736883  normal  0.107971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1234  hypothetical protein  28.05 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324963  hitchhiker  0.00019787 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1604  hypothetical protein  34.72 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3898  hypothetical protein  36.59 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.929293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3430  hypothetical protein  32.1 
 
 		 90 aa  42  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3305  hypothetical protein  32.89 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  34.67 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  34.55 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1064  hypothetical protein  32.88 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3384  hypothetical protein  33.77 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3204  hypothetical protein  33.77 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3216  hypothetical protein  33.77 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3279  hypothetical protein  33.77 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3282  hypothetical protein  33.77 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0346  hypothetical protein  36.21 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0382  hypothetical protein  36.21 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2151  hypothetical protein  34.25 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.164508  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0859  hypothetical protein  36.92 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0638  hypothetical protein  31.17 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0852  hypothetical protein  32.47 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002489  hypothetical protein  30.16 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.864152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3315  hypothetical protein  34.15 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2861  hypothetical protein  38.16 
 
 		 80 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>