55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1913 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  100 
 
 
101 aa  207  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  96.04 
 
 
101 aa  201  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  75.51 
 
 
103 aa  153  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  69.89 
 
 
115 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  56.67 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  55.06 
 
 
96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  52.53 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  53.93 
 
 
96 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  55.56 
 
 
98 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  50.51 
 
 
98 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  51.52 
 
 
98 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  50.51 
 
 
98 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  51.69 
 
 
96 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  49.44 
 
 
96 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  51.11 
 
 
98 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  45.56 
 
 
95 aa  100  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  45.56 
 
 
95 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  46.67 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  48.89 
 
 
98 aa  97.4  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  45.56 
 
 
96 aa  94.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  89.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  43.33 
 
 
122 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  46.99 
 
 
97 aa  89.7  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  47.83 
 
 
98 aa  88.2  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  51.11 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  43.04 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  40.74 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  38.27 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  43.42 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  42.7 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  44 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  41.33 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  38.24 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  35.37 
 
 
88 aa  63.5  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  40.54 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  35.9 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  35.9 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  40.68 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  38.81 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  32.05 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  32 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  38.24 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  34.72 
 
 
206 aa  51.2  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  30.11 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1539  protein of unknown function DUF339  32.89 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183643  normal  0.747807 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  34.72 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  33.33 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00599  TPR repeat region superfamily  33.33 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1752  hypothetical protein  25.88 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  0.110939 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  33.96 
 
 
296 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  31.17 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0063  hypothetical protein  32.88 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.848374 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  38.6 
 
 
83 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>