66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3080 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  211  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  49.41 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  49.41 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  48.24 
 
 		 98 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  49.41 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  48.24 
 
 		 98 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  47.06 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  55 
 
 		 96 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  47.31 
 
 		 96 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  55.41 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  47.06 
 
 		 98 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  48.31 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  51.25 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  43.53 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  49.37 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  48.72 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  48.72 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  44.83 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  47.44 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  48.68 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  46.67 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  47.06 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  40.74 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  50.65 
 
 		 81 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  39.51 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  45.33 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  41.67 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  39.29 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  48.75 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  42.17 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  41.33 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  37.33 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  40.24 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  42.31 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  37.66 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  35.71 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  36 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  34.57 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  34.52 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  40.3 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  36.76 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00599  TPR repeat region superfamily  28.57 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1539  protein of unknown function DUF339  29.33 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183643  normal  0.747807 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  41.3 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2938  hypothetical protein  25.76 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  28.99 
 
 		 86 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1028  hypothetical protein  25.33 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  37.74 
 
 		 296 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  35.19 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02692  hypothetical protein  29.17 
 
 		 88 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.213923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  26.39 
 
 		 88 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4188  hypothetical protein  29.17 
 
 		 88 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3317  hypothetical protein  29.17 
 
 		 88 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3030  hypothetical protein  29.17 
 
 		 88 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0812  hypothetical protein  29.17 
 
 		 88 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.463653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  26.39 
 
 		 88 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  26.39 
 
 		 88 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3223  hypothetical protein  29.17 
 
 		 88 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0795  protein of unknown function DUF339  29.17 
 
 		 88 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02729  hypothetical protein  29.17 
 
 		 88 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>