53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0893 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  199  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  55.67 
 
 		 98 aa  120  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  53.61 
 
 		 98 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  55.67 
 
 		 98 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  50.52 
 
 		 98 aa  117  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  55.67 
 
 		 98 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  54.74 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  53.61 
 
 		 98 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  52.22 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  51.11 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  51.11 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  55.56 
 
 		 98 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  52.58 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  47.92 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  48.24 
 
 		 97 aa  98.6  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  48.89 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  48.31 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  46.24 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  48.86 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  43.82 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  52.27 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  46.07 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  46.07 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  45.56 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  43.16 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  43.53 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  43.59 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  38.75 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  41.56 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  44.44 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  41.03 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  32.05 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  38.24 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  36 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  36 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  41.18 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  34.15 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  41.54 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  41.54 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  41.27 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1539  protein of unknown function DUF339  33.33 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183643  normal  0.747807 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00599  TPR repeat region superfamily  33.77 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  30.43 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  30.56 
 
 		 206 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  33.9 
 
 		 296 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  33.75 
 
 		 86 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  32 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1752  hypothetical protein  27.63 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  0.110939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2775  hypothetical protein  29.73 
 
 		 82 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>