36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA04680 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  100 
 
 
175 aa  352  1e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  49.06 
 
 
149 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  58.67 
 
 
296 aa  97.4  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  31.52 
 
 
98 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  33.73 
 
 
206 aa  51.2  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  30.38 
 
 
98 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  35.62 
 
 
98 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  31.33 
 
 
96 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  30.38 
 
 
98 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  29.35 
 
 
98 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  33.85 
 
 
88 aa  49.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  31.82 
 
 
92 aa  48.1  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  29.35 
 
 
98 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13630  hypothetical protein  37.33 
 
 
84 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  29.35 
 
 
98 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  35 
 
 
97 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  37.31 
 
 
89 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  36.67 
 
 
89 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  36.67 
 
 
89 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  37.1 
 
 
99 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  33.71 
 
 
98 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  30 
 
 
122 aa  44.7  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  29.63 
 
 
96 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  33.78 
 
 
120 aa  44.7  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54470  hypothetical protein  38.46 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234061  normal  0.929055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  30.77 
 
 
96 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  28.75 
 
 
96 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4760  hypothetical protein  38.46 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  27.85 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1464  hypothetical protein  36.21 
 
 
84 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00913316  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  33.73 
 
 
97 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  30.56 
 
 
92 aa  41.6  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2254  response regulator receiver domain-containing protein  37.74 
 
 
81 aa  41.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00897791  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  32 
 
 
98 aa  41.6  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  33.33 
 
 
79 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  32.88 
 
 
88 aa  41.2  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>