70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4162 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  199  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  97.96 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  94.9 
 
 		 98 aa  191  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  84.69 
 
 		 98 aa  174  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  78.57 
 
 		 98 aa  167  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  77.55 
 
 		 98 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  56.12 
 
 		 103 aa  117  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  55.67 
 
 		 98 aa  115  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  52.08 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  56.82 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  56.18 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  55.56 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  52.53 
 
 		 101 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  51.69 
 
 		 95 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  51.69 
 
 		 95 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  50.51 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  51.69 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  50.54 
 
 		 96 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  53.85 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  48.42 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  49.46 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  46.88 
 
 		 115 aa  99.4  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  52.22 
 
 		 98 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  57.45 
 
 		 95 aa  95.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  48.24 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  48.05 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  48.78 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  41.46 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  41.25 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  35.8 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  38.64 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  40.48 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  40.85 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  33.8 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  36.26 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  44.16 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  28 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  40.32 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  35.71 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  31.4 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  31.58 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  29.35 
 
 		 175 aa  47  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  31.25 
 
 		 296 aa  44.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1752  hypothetical protein  29.87 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  0.110939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  35 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1539  protein of unknown function DUF339  32.31 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183643  normal  0.747807 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  35 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00599  TPR repeat region superfamily  30.3 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  38.46 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0859  hypothetical protein  34.43 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002489  hypothetical protein  34.48 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.864152  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03545  hypothetical protein  38.78 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4188  hypothetical protein  27.91 
 
 		 88 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3317  hypothetical protein  27.91 
 
 		 88 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3030  hypothetical protein  27.91 
 
 		 88 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0812  hypothetical protein  27.91 
 
 		 88 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.463653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3223  hypothetical protein  27.91 
 
 		 88 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1339  hypothetical protein  34.55 
 
 		 82 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0795  protein of unknown function DUF339  27.91 
 
 		 88 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02692  hypothetical protein  27.91 
 
 		 88 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.213923  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3430  hypothetical protein  32.35 
 
 		 90 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02729  hypothetical protein  27.91 
 
 		 88 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>