45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0941 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  167  6e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  35.37 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  43.55 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  36.23 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  33.77 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  32.05 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  32.47 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  34.78 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  36 
 
 
101 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  35 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  34.78 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  32.47 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  32.47 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  31.88 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  34.78 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  34.78 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  34.78 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  34.78 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  28.92 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  28.92 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  32.05 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  32.05 
 
 
101 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  31.17 
 
 
120 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  39.29 
 
 
122 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  24.36 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 
98 aa  54.7  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  27.71 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  30.38 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  31.43 
 
 
206 aa  53.9  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  29.87 
 
 
99 aa  53.5  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  31.88 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  33.85 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  44.07 
 
 
92 aa  52  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  32.35 
 
 
92 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  32.86 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  32.86 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  32.86 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  29.49 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  29.87 
 
 
97 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  32.26 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  36.99 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  32.35 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  32.39 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3430  hypothetical protein  29.87 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>