60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2212 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  100 
 
 		 98 aa  193  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  54.74 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  57.78 
 
 		 98 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  51.69 
 
 		 95 aa  103  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  51.69 
 
 		 95 aa  103  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  54.44 
 
 		 98 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  52.22 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  47.96 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  50.56 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  50 
 
 		 98 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  53.33 
 
 		 98 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  52.22 
 
 		 98 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  51.72 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  48.24 
 
 		 115 aa  90.5  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  47.83 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  46.67 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  47.19 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  44.58 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  46.74 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  49.37 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  43.82 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  39.33 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  41.57 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  41.3 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  39.58 
 
 		 96 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  38.64 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  46.27 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  47.78 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  36 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  28.24 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  35 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  37.18 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  37.33 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  38.57 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  42.65 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  38.16 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  40.54 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  39.19 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  38.46 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  38.46 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  40.3 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  36.25 
 
 		 206 aa  50.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  33.77 
 
 		 296 aa  50.4  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  36.76 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  35.62 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1752  hypothetical protein  33.77 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  0.110939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1028  hypothetical protein  40.68 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  47.37 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1139  hypothetical protein  40.74 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2775  hypothetical protein  37.14 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  36.67 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  38.33 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1045  hypothetical protein  40.74 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.453082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2938  hypothetical protein  34.33 
 
 		 83 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  35.14 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  34.72 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>