73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4261 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  196  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  60.22 
 
 
98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  58.06 
 
 
98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  56.67 
 
 
98 aa  110  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  56.67 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  55.56 
 
 
98 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  55.56 
 
 
98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  55.56 
 
 
98 aa  107  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  55.06 
 
 
96 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  53.68 
 
 
96 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  55.06 
 
 
96 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  53.76 
 
 
96 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  57.78 
 
 
98 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  52.81 
 
 
101 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  55.81 
 
 
115 aa  103  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  52.81 
 
 
95 aa  103  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  52.81 
 
 
95 aa  103  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  51.11 
 
 
101 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  55.81 
 
 
103 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  51.69 
 
 
95 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  56.32 
 
 
120 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  50 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  48.31 
 
 
96 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  49.41 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  45.88 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  52.17 
 
 
95 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  39.53 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  46.75 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  41.18 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  42.11 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  35.9 
 
 
93 aa  72  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  43.37 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  40.96 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  43.24 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  38.16 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  35.29 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  39.44 
 
 
86 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  32.47 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  37.33 
 
 
93 aa  57.4  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  30.67 
 
 
92 aa  57  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  35.82 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  35.82 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  34.62 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  33.33 
 
 
206 aa  51.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  33.82 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  43.1 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  43.1 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  43.1 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  33.71 
 
 
175 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  33.82 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  27.17 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1539  protein of unknown function DUF339  35.48 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183643  normal  0.747807 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2938  hypothetical protein  30.26 
 
 
83 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  29.73 
 
 
296 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02692  hypothetical protein  40.68 
 
 
88 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.213923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0638  hypothetical protein  37.93 
 
 
88 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4188  hypothetical protein  40.68 
 
 
88 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3317  hypothetical protein  40.68 
 
 
88 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3030  hypothetical protein  40.68 
 
 
88 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0812  hypothetical protein  40.68 
 
 
88 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.463653  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3223  hypothetical protein  40.68 
 
 
88 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0795  protein of unknown function DUF339  40.68 
 
 
88 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02729  hypothetical protein  40.68 
 
 
88 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166664  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3216  hypothetical protein  38.33 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3204  hypothetical protein  38.33 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3384  hypothetical protein  38.33 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3279  hypothetical protein  38.33 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3282  hypothetical protein  38.33 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  39.29 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  39.29 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1028  hypothetical protein  31.82 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3315  hypothetical protein  36.99 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>