57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1645 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  201  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  86.73 
 
 		 98 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  86.73 
 
 		 98 aa  175  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  84.69 
 
 		 98 aa  174  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  75.51 
 
 		 98 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  75.51 
 
 		 98 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0893  hypothetical protein  55.67 
 
 		 98 aa  120  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.306935 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1400  hypothetical protein  56.12 
 
 		 103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2937  protein of unknown function DUF339  53.12 
 
 		 96 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  56.82 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4261  hypothetical protein  56.67 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.570948  normal  0.0928538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  56.04 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2609  hypothetical protein  50.54 
 
 		 96 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.39305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  55.06 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1729  protein of unknown function DUF339  51.52 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1913  protein of unknown function DUF339  50.51 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2621  hypothetical protein  51.61 
 
 		 96 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  hitchhiker  0.000726725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2851  hypothetical protein  49.47 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0545  hypothetical protein  51.69 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3641  hypothetical protein  51.69 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0580  hypothetical protein  51.69 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.20167  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2364  hypothetical protein  47.92 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2212  protein of unknown function DUF339  52.22 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4158  hypothetical protein  56.38 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3080  hypothetical protein  49.41 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125777 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0797  hypothetical protein  48.1 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2618  hypothetical protein  46.34 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2652  hypothetical protein  49.28 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0195633  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  43.21 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0764  protein of unknown function DUF339  41.25 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0108  protein of unknown function DUF339  41.77 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0972261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1727  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0241005  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1069  TPR repeat-containing protein  38.96 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273395  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0861  hypothetical protein  37.04 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0941  hypothetical protein  36.23 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.106538  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1087  hypothetical protein  30.67 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.172132  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0937  hypothetical protein  51.92 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1732  hypothetical protein  32.5 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.830554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0761  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2420  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70398  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0414  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1517  hypothetical protein  34.52 
 
 		 88 aa  57  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43817  predicted protein  33.72 
 
 		 206 aa  57  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0473443  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53561  predicted protein  34.57 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.793096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1652  hypothetical protein  42.42 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1981  hypothetical protein  35.16 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1752  hypothetical protein  35.53 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  0.110939 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04164  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13180)  29.67 
 
 		 296 aa  50.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  29.35 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  42.86 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  37.29 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  33.8 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  40.82 
 
 		 86 aa  40.8  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  37.29 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>