53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0533 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  624  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  75.16 
 
 		 308 aa  477  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  71.66 
 
 		 307 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  72.55 
 
 		 308 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  70.36 
 
 		 307 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  71.15 
 
 		 308 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  71.8 
 
 		 308 aa  464  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  71.29 
 
 		 309 aa  461  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  72.9 
 
 		 310 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  70.49 
 
 		 327 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  71.57 
 
 		 312 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  72.46 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  72.17 
 
 		 308 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  67.43 
 
 		 308 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  67.43 
 
 		 308 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  67.74 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  69.23 
 
 		 311 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  68.42 
 
 		 307 aa  428  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  67.43 
 
 		 307 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  67.54 
 
 		 306 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  65.1 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  61.97 
 
 		 313 aa  408  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  63.91 
 
 		 309 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  62.14 
 
 		 310 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  58.28 
 
 		 313 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  59.53 
 
 		 312 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  60.14 
 
 		 302 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  55.41 
 
 		 309 aa  364  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  57.77 
 
 		 310 aa  348  9e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  54.88 
 
 		 311 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  54.33 
 
 		 313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  54.55 
 
 		 313 aa  332  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  54.39 
 
 		 309 aa  315  8e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  74.1 
 
 		 139 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  35.32 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  38.66 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  36.4 
 
 		 347 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  36.18 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  35.84 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  32.66 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  32.66 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  32.74 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  29.02 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  28.32 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  35.14 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  43.75 
 
 		 123 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  29.57 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  33.96 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3001  hypothetical protein  33.73 
 
 		 126 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0119263  hitchhiker  0.00226887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2646  hypothetical protein  28.85 
 
 		 131 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2151  hypothetical protein  28.18 
 
 		 125 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3917  hypothetical protein  32.17 
 
 		 127 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4469  hypothetical protein  31.4 
 
 		 131 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00503662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>