50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0718 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  89.94 
 
 		 308 aa  580  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  78.57 
 
 		 401 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  77.92 
 
 		 308 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  73.7 
 
 		 308 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  73.7 
 
 		 308 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  71.76 
 
 		 307 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  71.33 
 
 		 307 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  69.18 
 
 		 307 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  70.76 
 
 		 308 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  70.49 
 
 		 306 aa  447  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  71.15 
 
 		 307 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  68.2 
 
 		 307 aa  447  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  70.1 
 
 		 308 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  69.81 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  68.77 
 
 		 309 aa  443  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  68.11 
 
 		 311 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  66.88 
 
 		 327 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  67.53 
 
 		 312 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  66.45 
 
 		 310 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  65.56 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  60.98 
 
 		 313 aa  397  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  60.66 
 
 		 310 aa  391  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  61.18 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  60.87 
 
 		 313 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  58.25 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  58.67 
 
 		 302 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  56.52 
 
 		 312 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  59.39 
 
 		 311 aa  359  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  57.43 
 
 		 310 aa  348  8e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  57.33 
 
 		 313 aa  347  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  57.44 
 
 		 313 aa  347  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  57.89 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  75.91 
 
 		 139 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  37.5 
 
 		 347 aa  182  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  39.63 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  36.26 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  37.31 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  37.31 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  34.88 
 
 		 315 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  31.54 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  31.54 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  29.75 
 
 		 310 aa  119  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  30.36 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  41.98 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  34.23 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  31.62 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  36.84 
 
 		 137 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2646  hypothetical protein  29.63 
 
 		 131 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2151  hypothetical protein  29.63 
 
 		 125 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>