52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3336 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  617  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  79.47 
 
 		 339 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  77.41 
 
 		 311 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  75.83 
 
 		 327 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  78.52 
 
 		 308 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  76.49 
 
 		 312 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  75.17 
 
 		 307 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  74.5 
 
 		 307 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  74.5 
 
 		 309 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  74.83 
 
 		 308 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  73.18 
 
 		 307 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  70.63 
 
 		 310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  73.75 
 
 		 307 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  72.97 
 
 		 306 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  69.1 
 
 		 309 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  65.89 
 
 		 313 aa  418  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  69.21 
 
 		 401 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  69.21 
 
 		 308 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  66.89 
 
 		 308 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  65.56 
 
 		 308 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  64.9 
 
 		 313 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  66.34 
 
 		 310 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  63.91 
 
 		 309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  65.56 
 
 		 308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  65.56 
 
 		 308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  64.95 
 
 		 302 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  62.91 
 
 		 312 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  65.1 
 
 		 307 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  65.17 
 
 		 311 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  60.7 
 
 		 313 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  64.14 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  61.05 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  62.41 
 
 		 313 aa  358  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  88.32 
 
 		 139 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  35.05 
 
 		 347 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  34.94 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  37.5 
 
 		 359 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  35.15 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  34.47 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  30.51 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  31.33 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  32.34 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  31.9 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  30.77 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  36.04 
 
 		 117 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  42.17 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  31.36 
 
 		 123 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  34.29 
 
 		 137 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4151  hypothetical protein  29.81 
 
 		 178 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0043925  normal  0.91822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2646  hypothetical protein  30.56 
 
 		 131 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2151  hypothetical protein  30.48 
 
 		 125 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4469  hypothetical protein  29.27 
 
 		 131 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00503662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>