46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3660 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  629  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  96.76 
 
 		 309 aa  609  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  34.22 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  32.62 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  33.22 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  33.56 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  33.94 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  32.37 
 
 		 313 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  33.22 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  32.23 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  32.98 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  30.51 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  32.48 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  32.89 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  31.21 
 
 		 339 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  32.89 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  31.53 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  33.78 
 
 		 313 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  33.81 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  31.31 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  32.49 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  31.54 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  31.21 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  32 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  31.88 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  30.87 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  31.99 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  32.23 
 
 		 306 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  29.97 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  29.97 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  33.11 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  31.8 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  31.29 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  30.77 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  31 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  31.47 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  31.68 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  31.06 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  31.82 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  31.07 
 
 		 359 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  35 
 
 		 139 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  26.97 
 
 		 347 aa  85.9  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  29.58 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  30.04 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3001  hypothetical protein  32.14 
 
 		 126 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0119263  hitchhiker  0.00226887 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  29.91 
 
 		 117 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>