51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3024 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  631  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  93.18 
 
 		 401 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  80.19 
 
 		 308 aa  527  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  80.19 
 
 		 308 aa  527  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  77.92 
 
 		 308 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  76.95 
 
 		 308 aa  508  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  77.08 
 
 		 307 aa  482  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  74.75 
 
 		 308 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  74.67 
 
 		 307 aa  471  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  71.84 
 
 		 307 aa  472  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  72.4 
 
 		 327 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  71.84 
 
 		 307 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  72.04 
 
 		 339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  73.6 
 
 		 306 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  72.13 
 
 		 308 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  71.94 
 
 		 312 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  71.01 
 
 		 309 aa  459  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  72.67 
 
 		 311 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  72.17 
 
 		 307 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  68.71 
 
 		 310 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  69.21 
 
 		 304 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  65.69 
 
 		 310 aa  414  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  62.62 
 
 		 313 aa  407  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  64.8 
 
 		 309 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  62.62 
 
 		 313 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  61.17 
 
 		 309 aa  394  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  60.41 
 
 		 302 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  58.36 
 
 		 312 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  60.73 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  59.6 
 
 		 313 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  57.48 
 
 		 310 aa  349  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  57.14 
 
 		 313 aa  346  3e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  57.39 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  80.85 
 
 		 139 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  39.63 
 
 		 359 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  38.7 
 
 		 317 aa  169  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  37.33 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  37.82 
 
 		 347 aa  166  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  34.94 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  34.41 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  30.77 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  30.43 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  29.39 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  29.03 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  43.21 
 
 		 123 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  31.53 
 
 		 117 aa  57  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  30.77 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  35.05 
 
 		 137 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4151  hypothetical protein  32.69 
 
 		 178 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0043925  normal  0.91822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2646  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2151  hypothetical protein  32.41 
 
 		 125 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>