41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2646 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2646  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2151  hypothetical protein  96.8 
 
 		 125 aa  246  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4151  hypothetical protein  37.4 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0043925  normal  0.91822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  30.77 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  33.98 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63740  hypothetical protein  38.66 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0291874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  33.05 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  35.45 
 
 		 309 aa  57.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  33.64 
 
 		 302 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  35.24 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  34.82 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  33.65 
 
 		 313 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  34.23 
 
 		 311 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  31.73 
 
 		 327 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  30.84 
 
 		 309 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  29.81 
 
 		 312 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  30.63 
 
 		 310 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  30.77 
 
 		 307 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  32.41 
 
 		 308 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  29.81 
 
 		 313 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  30.77 
 
 		 307 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  30.63 
 
 		 339 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  30.77 
 
 		 308 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  30.63 
 
 		 309 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  31.43 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  29.52 
 
 		 310 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  30.56 
 
 		 308 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  30.56 
 
 		 308 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  28.85 
 
 		 307 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  29.52 
 
 		 309 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  30.48 
 
 		 312 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3917  hypothetical protein  29.09 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  30.56 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1561  hypothetical protein  24.19 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  32.35 
 
 		 307 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  30.77 
 
 		 308 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  29.63 
 
 		 308 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  30.39 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  31.37 
 
 		 401 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  30.39 
 
 		 307 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>