53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4225 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  638    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  73.2 
 
 		 313 aa  481  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  69.01 
 
 		 313 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  66 
 
 		 309 aa  427  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  66.45 
 
 		 308 aa  427  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  66.78 
 
 		 308 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  66.45 
 
 		 307 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  64.44 
 
 		 339 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  65.45 
 
 		 307 aa  421  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  62.82 
 
 		 327 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  64.38 
 
 		 312 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  66.56 
 
 		 306 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  66.56 
 
 		 307 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  66.22 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  64.85 
 
 		 311 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  62.58 
 
 		 309 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  62.91 
 
 		 304 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  62.42 
 
 		 310 aa  394  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  61.41 
 
 		 310 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  57.7 
 
 		 309 aa  378  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  58.36 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  59.25 
 
 		 302 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  59.53 
 
 		 307 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  56.52 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  56.39 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  56.39 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  57.57 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  58.36 
 
 		 308 aa  358  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  58.36 
 
 		 401 aa  358  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  56.77 
 
 		 309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  57.75 
 
 		 313 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  56.77 
 
 		 313 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  54.97 
 
 		 310 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  66.42 
 
 		 139 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  36.5 
 
 		 324 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  41.42 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  41.04 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  36.11 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  38.6 
 
 		 359 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  37.64 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  34.22 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  34.22 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  30.42 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  27.84 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  31.15 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  38.75 
 
 		 123 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4151  hypothetical protein  30.77 
 
 		 178 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0043925  normal  0.91822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  37.63 
 
 		 137 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2646  hypothetical protein  29.81 
 
 		 131 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2151  hypothetical protein  28.83 
 
 		 125 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1561  hypothetical protein  29.37 
 
 		 135 aa  46.2  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3917  hypothetical protein  31.09 
 
 		 127 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>