17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1561 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1561  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  276  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4151  hypothetical protein  37.21 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0043925  normal  0.91822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  33.81 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  33.87 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  34.71 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3917  hypothetical protein  32.8 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  29.37 
 
 
312 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  29.03 
 
 
311 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2646  hypothetical protein  24.19 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  28.69 
 
 
313 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  27.56 
 
 
302 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2151  hypothetical protein  23.39 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  26.4 
 
 
309 aa  41.6  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  27.27 
 
 
310 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  25.2 
 
 
309 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  25.4 
 
 
313 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  27.56 
 
 
309 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>