34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3917 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3917  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  258  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  54.01 
 
 
137 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  45.79 
 
 
117 aa  90.1  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4151  hypothetical protein  38.52 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0043925  normal  0.91822 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  35.59 
 
 
311 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  32.76 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1561  hypothetical protein  32.8 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3001  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0119263  hitchhiker  0.00226887 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  36.61 
 
 
310 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  37.17 
 
 
302 aa  50.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  35.87 
 
 
313 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  33.61 
 
 
309 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0551  hypothetical protein  38.71 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2745  hypothetical protein  27.47 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  29.41 
 
 
309 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2646  hypothetical protein  29.09 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2746  hypothetical protein  22.32 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2151  hypothetical protein  28.18 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  31.36 
 
 
339 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1823  hypothetical protein  21.43 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00241932  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  32.17 
 
 
307 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  31.09 
 
 
312 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  33.64 
 
 
401 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  33.04 
 
 
307 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  31.82 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  29.82 
 
 
309 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  30.63 
 
 
313 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  30.51 
 
 
327 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  30.51 
 
 
312 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  33.04 
 
 
307 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  30.51 
 
 
304 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  31.13 
 
 
308 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2748  hypothetical protein  21.21 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  30.77 
 
 
308 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0410908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>