22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3001 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3001  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  256  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0119263  hitchhiker  0.00226887 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4469  hypothetical protein  38.66 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00503662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3917  hypothetical protein  39.13 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  32.14 
 
 		 309 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  32.14 
 
 		 309 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  31.62 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  34.15 
 
 		 307 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  30.17 
 
 		 327 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  30.51 
 
 		 310 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5052  hypothetical protein  33 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  29.41 
 
 		 309 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  31.36 
 
 		 313 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2745  hypothetical protein  32.69 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  30.83 
 
 		 313 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  32.84 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  31.03 
 
 		 312 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  28.85 
 
 		 308 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  28.85 
 
 		 308 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  29.06 
 
 		 302 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  30.86 
 
 		 308 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2746  hypothetical protein  26.88 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  29.52 
 
 		 307 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>