52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0375 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  638    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  65.35 
 
 		 308 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  63.04 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  64.21 
 
 		 302 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  62.66 
 
 		 339 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  62.95 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  63.61 
 
 		 307 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  60.52 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  63.91 
 
 		 304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  63.16 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  61.04 
 
 		 312 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  65.56 
 
 		 307 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  63.79 
 
 		 307 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  63.51 
 
 		 311 aa  391  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  62.83 
 
 		 306 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  62.79 
 
 		 309 aa  391  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  61.81 
 
 		 401 aa  384  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  59.34 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  61.17 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  58.25 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  57.7 
 
 		 312 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  58.36 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  62.21 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  56.63 
 
 		 310 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  55.66 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  56.07 
 
 		 313 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  55.66 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  57.72 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  55.63 
 
 		 313 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  55.41 
 
 		 307 aa  352  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  58.17 
 
 		 311 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  56.51 
 
 		 313 aa  322  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  52.75 
 
 		 309 aa  315  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  59.71 
 
 		 139 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  36.02 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  34.38 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  37.1 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  34.32 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  35.06 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  32.71 
 
 		 324 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  31.8 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  31.8 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  32.72 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  31.87 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  31.09 
 
 		 123 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2646  hypothetical protein  35.45 
 
 		 131 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2151  hypothetical protein  34.55 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  32.63 
 
 		 137 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  24.78 
 
 		 117 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  34.67 
 
 		 123 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3917  hypothetical protein  29.41 
 
 		 127 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4151  hypothetical protein  30.09 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0043925  normal  0.91822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>