54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1482 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  86.52 
 
 		 339 aa  256  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  84.89 
 
 		 309 aa  254  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  85.61 
 
 		 308 aa  251  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  88.32 
 
 		 304 aa  250  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  82.73 
 
 		 307 aa  248  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  82.01 
 
 		 308 aa  247  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  83.45 
 
 		 307 aa  248  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  83.21 
 
 		 312 aa  247  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  82.48 
 
 		 327 aa  246  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  81.88 
 
 		 311 aa  243  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  80.85 
 
 		 308 aa  233  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  80.29 
 
 		 401 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  76.76 
 
 		 310 aa  228  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  74.1 
 
 		 307 aa  224  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  77.61 
 
 		 308 aa  223  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  76.64 
 
 		 307 aa  222  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  73.19 
 
 		 309 aa  222  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  75.91 
 
 		 308 aa  222  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  74.64 
 
 		 306 aa  220  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  73.19 
 
 		 308 aa  219  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  73.19 
 
 		 308 aa  219  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  75.36 
 
 		 307 aa  218  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  70.21 
 
 		 313 aa  216  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  69.57 
 
 		 313 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  72.18 
 
 		 311 aa  207  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  71.43 
 
 		 313 aa  205  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  66.18 
 
 		 302 aa  203  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  66.42 
 
 		 312 aa  199  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  69.92 
 
 		 309 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  59.71 
 
 		 309 aa  181  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  59.71 
 
 		 310 aa  177  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  57.35 
 
 		 313 aa  173  9e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  56.62 
 
 		 310 aa  163  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  39.85 
 
 		 347 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  37.59 
 
 		 324 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  41.35 
 
 		 359 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  39.86 
 
 		 317 aa  93.6  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  39.86 
 
 		 317 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  35 
 
 		 309 aa  87.8  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  35 
 
 		 309 aa  87.4  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  34.27 
 
 		 315 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  36.04 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  29.57 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  35.58 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  35.78 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  36.46 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4151  hypothetical protein  30.77 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0043925  normal  0.91822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2151  hypothetical protein  31.43 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2646  hypothetical protein  31.43 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2745  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3917  hypothetical protein  31.82 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.11 
 
 		 1016 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>