53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7719 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  627  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  97.72 
 
 		 307 aa  618  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  87.99 
 
 		 308 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  86.69 
 
 		 308 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  84.87 
 
 		 309 aa  536  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  83.33 
 
 		 339 aa  534  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  79.87 
 
 		 327 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  82 
 
 		 311 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  79.22 
 
 		 312 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  78.36 
 
 		 307 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  75.16 
 
 		 310 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  76.55 
 
 		 306 aa  487  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  78.45 
 
 		 307 aa  485  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  76.07 
 
 		 310 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  72.61 
 
 		 309 aa  474  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  75.17 
 
 		 304 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  71.66 
 
 		 307 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  69.84 
 
 		 308 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  68.63 
 
 		 313 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  69.18 
 
 		 308 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  71.84 
 
 		 308 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  72.13 
 
 		 401 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  68.95 
 
 		 313 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  67.1 
 
 		 308 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  67.1 
 
 		 308 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  66.45 
 
 		 312 aa  428  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  67.01 
 
 		 302 aa  415  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  63.61 
 
 		 309 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  62.96 
 
 		 311 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  59.21 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  59.58 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  56.9 
 
 		 313 aa  349  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  59.65 
 
 		 309 aa  345  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  83.45 
 
 		 139 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  37.54 
 
 		 317 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  37.54 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  37.09 
 
 		 347 aa  168  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  38.29 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  36.06 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  36.43 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  33.22 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  33.22 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  30.07 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  28.05 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  35.14 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  33.05 
 
 		 123 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  42.5 
 
 		 123 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  37.76 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4151  hypothetical protein  29.09 
 
 		 178 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0043925  normal  0.91822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2198  hypothetical protein  72.97 
 
 		 36 aa  49.3  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2646  hypothetical protein  30.77 
 
 		 131 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2151  hypothetical protein  30 
 
 		 125 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3917  hypothetical protein  33.04 
 
 		 127 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>