45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5166 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  738    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  76.04 
 
 		 324 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  57.06 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  39.63 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  39.26 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  39.71 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  38.89 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  41.22 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  39.31 
 
 		 308 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  39.03 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  40.15 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  39.69 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  39.93 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  40.75 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  39.93 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  38.29 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  39.33 
 
 		 310 aa  176  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  38.66 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  38.26 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  40 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  38.29 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  37.69 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  38.6 
 
 		 312 aa  172  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  37.92 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  39.63 
 
 		 308 aa  172  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  39.26 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  36.4 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  37.64 
 
 		 309 aa  169  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  36.43 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  37.55 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  38.29 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  37.5 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  37.08 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  34.26 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  34.69 
 
 		 309 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  34.57 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  35.47 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  35.55 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  32.45 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  31.84 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  32.46 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  41.35 
 
 		 139 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  31.07 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  31.07 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  59.04 
 
 		 123 aa  99.4  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>