46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3977 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  712    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  56.1 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  57.06 
 
 		 359 aa  355  8.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  89.43 
 
 		 123 aa  202  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  39.69 
 
 		 311 aa  185  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  40.23 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  37.5 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  40.74 
 
 		 308 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  35.05 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  39.41 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  37.55 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  37.13 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  38.55 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  39.27 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  38.35 
 
 		 308 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  38.29 
 
 		 307 aa  169  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  37.09 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  37 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  34.51 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  36.96 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  37.82 
 
 		 308 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  35.45 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  36.11 
 
 		 312 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  36.4 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  33.96 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  39.43 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  34.93 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  36.82 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  36.82 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  32.39 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  35.34 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  33.95 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  35.96 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  34.35 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  36.02 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  31.95 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  35.16 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  35.4 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  31.18 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  31.12 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  30.42 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  27.91 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  39.85 
 
 		 139 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  26.97 
 
 		 309 aa  85.9  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  26.97 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>