48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3830 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  634    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  74.76 
 
 		 308 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  76.07 
 
 		 307 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  76.07 
 
 		 307 aa  477  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  75.5 
 
 		 311 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  72.49 
 
 		 308 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  73.31 
 
 		 339 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  71.9 
 
 		 309 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  70.07 
 
 		 327 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  70.87 
 
 		 312 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  68.39 
 
 		 310 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  68.71 
 
 		 307 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  68.71 
 
 		 307 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  67.74 
 
 		 306 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  66.34 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  62.26 
 
 		 309 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  63.07 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  62.66 
 
 		 313 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  63.19 
 
 		 313 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  65.27 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  65.69 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  61.41 
 
 		 312 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  60.66 
 
 		 308 aa  391  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  62.14 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  61.74 
 
 		 308 aa  381  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  61.74 
 
 		 308 aa  381  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  62.21 
 
 		 309 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  59.32 
 
 		 302 aa  355  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  56.67 
 
 		 310 aa  331  9e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  55.22 
 
 		 311 aa  328  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  55.28 
 
 		 313 aa  323  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  52.9 
 
 		 313 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  55.09 
 
 		 309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  59.71 
 
 		 139 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  39.27 
 
 		 347 aa  172  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  36.8 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  40.75 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  34.19 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  32.54 
 
 		 317 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  31.65 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  31.29 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  31.29 
 
 		 309 aa  116  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  32.56 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  28.83 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  41.25 
 
 		 123 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  35.8 
 
 		 123 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  25 
 
 		 117 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2198  hypothetical protein  61.76 
 
 		 36 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>