45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5341 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  627  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  70.96 
 
 
310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  31.18 
 
 
347 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  31.91 
 
 
309 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  29.75 
 
 
308 aa  119  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  31.9 
 
 
311 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  30.9 
 
 
313 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  30.82 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  29.39 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  30.82 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  31.87 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  31.84 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  30.63 
 
 
327 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  28.05 
 
 
308 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  29.72 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  30.63 
 
 
312 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  30.45 
 
 
324 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  29.39 
 
 
308 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  30.77 
 
 
304 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  28.83 
 
 
310 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  28.38 
 
 
307 aa  106  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  29.76 
 
 
310 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  27.39 
 
 
308 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  29.03 
 
 
311 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  28.05 
 
 
307 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  29.75 
 
 
309 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  31.45 
 
 
302 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  29.39 
 
 
401 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  28.32 
 
 
307 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  28.29 
 
 
310 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  29.43 
 
 
308 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  29.43 
 
 
308 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  27.84 
 
 
312 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  28.67 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  28.32 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  27.72 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  28.21 
 
 
309 aa  94  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  27.82 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  27.52 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  27.82 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  27.54 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  29.58 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  31.22 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  35.78 
 
 
139 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  34.38 
 
 
123 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>