47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2193 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  643    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  97.16 
 
 		 317 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  55.67 
 
 		 315 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  39.86 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  39.43 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  37.54 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  37.33 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  36.52 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  36.11 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  35.74 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  35.74 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  36.52 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  41.04 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  37.31 
 
 		 308 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  37.68 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  36.52 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  36.99 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  37.28 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  38.24 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  36.12 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  36.97 
 
 		 309 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  37.33 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  33.79 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  35.22 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  35.84 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  34.67 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  37.12 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  33.45 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  35.23 
 
 		 339 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  35.88 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  34.47 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  34.75 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  37.1 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  32.84 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  35.83 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  35.55 
 
 		 359 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  31.65 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  34.87 
 
 		 309 aa  139  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  30.42 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  31.2 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  31.06 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  39.86 
 
 		 139 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  31.13 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  27.52 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  30.38 
 
 		 123 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  46.77 
 
 		 117 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  37.23 
 
 		 137 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>