52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4023 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  623  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  92.83 
 
 
306 aa  578  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  92.18 
 
 
307 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  78.36 
 
 
307 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  79.08 
 
 
308 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  77.7 
 
 
307 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  77.78 
 
 
308 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  75.64 
 
 
312 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  74.68 
 
 
327 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  75.24 
 
 
309 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  75.17 
 
 
311 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  72.44 
 
 
339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  77.08 
 
 
308 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  76.55 
 
 
401 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  73.29 
 
 
308 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  73.29 
 
 
308 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  71.76 
 
 
308 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  71.1 
 
 
308 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  70.13 
 
 
310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  73.18 
 
 
304 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  70.43 
 
 
309 aa  435  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  69.54 
 
 
313 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  69.21 
 
 
313 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  68.71 
 
 
310 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  68.42 
 
 
307 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  66.56 
 
 
312 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  65.56 
 
 
309 aa  401  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  65.53 
 
 
302 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  64.21 
 
 
311 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  61.13 
 
 
313 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  59.34 
 
 
310 aa  358  6e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  61.43 
 
 
313 aa  344  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  59.45 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  76.64 
 
 
139 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  36.96 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  39.34 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  38.26 
 
 
359 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  38.24 
 
 
317 aa  162  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  35.07 
 
 
324 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  37.26 
 
 
315 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  33.11 
 
 
309 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  33.11 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  29.03 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  27.72 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  41.98 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  31.62 
 
 
123 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  56.2  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  36.73 
 
 
137 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4151  hypothetical protein  31.86 
 
 
178 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0043925  normal  0.91822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2151  hypothetical protein  31.48 
 
 
125 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2646  hypothetical protein  32.35 
 
 
131 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2198  hypothetical protein  59.46 
 
 
36 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>