52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5569 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  631  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  70.79 
 
 		 311 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  67.8 
 
 		 313 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  64.14 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  59.8 
 
 		 339 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  60.78 
 
 		 309 aa  358  7e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  59.22 
 
 		 313 aa  357  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  56.77 
 
 		 312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  60.78 
 
 		 308 aa  350  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  59.31 
 
 		 309 aa  348  5e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  59.11 
 
 		 327 aa  348  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  61.84 
 
 		 308 aa  348  6e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  59.65 
 
 		 307 aa  345  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  59.45 
 
 		 312 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  58.42 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  59.3 
 
 		 307 aa  343  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  58.8 
 
 		 311 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  57.68 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  59.79 
 
 		 307 aa  331  8e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  58.36 
 
 		 310 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  57.89 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  57.84 
 
 		 302 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  59.45 
 
 		 307 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  57.73 
 
 		 306 aa  322  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  58.42 
 
 		 401 aa  316  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  52.75 
 
 		 309 aa  315  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  57.39 
 
 		 308 aa  315  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  55.09 
 
 		 310 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  53.61 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  53.61 
 
 		 308 aa  306  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  54.39 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  52.6 
 
 		 313 aa  297  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  52.6 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  69.92 
 
 		 139 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  35.34 
 
 		 347 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  37.68 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  37.32 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  34.81 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  36.13 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  36.76 
 
 		 359 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  32.98 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  33.57 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  31.91 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  31.18 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  33.03 
 
 		 117 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  34.38 
 
 		 123 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  34.62 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4151  hypothetical protein  32.35 
 
 		 178 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0043925  normal  0.91822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3917  hypothetical protein  33.61 
 
 		 127 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2646  hypothetical protein  30.84 
 
 		 131 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2151  hypothetical protein  30.77 
 
 		 125 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>