43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5081 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  249  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  89.43 
 
 		 347 aa  219  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  56.1 
 
 		 324 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  59.04 
 
 		 359 aa  87.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  47.5 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  43.21 
 
 		 308 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  43.75 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  45 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  41.98 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  41.98 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  41.98 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  42.17 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  43.75 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  43.21 
 
 		 401 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  41.98 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  41.98 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  40.74 
 
 		 306 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  45 
 
 		 308 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  43.21 
 
 		 308 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  43.75 
 
 		 327 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  42.5 
 
 		 307 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  42.5 
 
 		 311 aa  63.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  42.5 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  43.75 
 
 		 307 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  43.75 
 
 		 313 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  41.25 
 
 		 310 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  41.25 
 
 		 309 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  40 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  41.25 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  41.25 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  40.48 
 
 		 313 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  42.86 
 
 		 309 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  38.75 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  38.75 
 
 		 312 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  38.75 
 
 		 302 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  38.82 
 
 		 310 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  30.38 
 
 		 317 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  30.38 
 
 		 317 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  34.38 
 
 		 310 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  34.67 
 
 		 309 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  41.82 
 
 		 310 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  29.41 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>