193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2485 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2485  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  239  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0586  hypothetical protein  52.88 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.101078  decreased coverage  0.000251226 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0454  protein of unknown function UPF0029  46.36 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  36.07 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  35.9 
 
 		 208 aa  70.1  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  37.72 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  37.72 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  38.39 
 
 		 213 aa  67.4  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.76 
 
 		 208 aa  67  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  34.78 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  40.74 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  38.89 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  38.89 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  38.89 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  36.08 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  38.89 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  38.89 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  37.96 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  27.78 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  28.83 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  30.91 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  38.74 
 
 		 290 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  38.74 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  31.53 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  41.53 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  39.47 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  37.11 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  28.46 
 
 		 212 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  28.46 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  28.46 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  28.46 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  28.46 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  28.46 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  36.94 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  28.69 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  28.46 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  28.46 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  38.89 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  27.64 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  29.73 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  36.04 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  27.78 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  32.76 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  35.71 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  36.61 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  37.04 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  37.39 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  37.39 
 
 		 239 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  30.97 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  34.23 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  38.89 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  28.04 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  31.9 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  37.5 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  31.4 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  33.04 
 
 		 204 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  35.09 
 
 		 198 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  35.05 
 
 		 212 aa  57  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  31.25 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  36.13 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  28.83 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  35.78 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  34.26 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  27.93 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  35.14 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2202  hypothetical protein  34.68 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.480648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  33.93 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  29.31 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  38.46 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  32.28 
 
 		 204 aa  53.9  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  37.04 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  33.04 
 
 		 204 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  35.51 
 
 		 197 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  35.29 
 
 		 204 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  37.76 
 
 		 206 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  31.03 
 
 		 204 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  34.78 
 
 		 225 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0960  hypothetical protein  41.27 
 
 		 219 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  34.23 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  28.7 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  38.14 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  38.14 
 
 		 303 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  35.4 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  26.23 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  34.31 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  38.14 
 
 		 303 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  38.14 
 
 		 303 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  38.14 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  38.14 
 
 		 303 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  35.85 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  31.62 
 
 		 204 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  31.5 
 
 		 203 aa  52  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  32.35 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  30.7 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  32.35 
 
 		 204 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  35.14 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>