184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0586 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0586  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.101078  decreased coverage  0.000251226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2485  hypothetical protein  52.88 
 
 
122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0454  protein of unknown function UPF0029  49.58 
 
 
119 aa  115  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  37.19 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  34.15 
 
 
198 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  35.25 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  34.31 
 
 
195 aa  67.4  0.00000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  36.79 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  30.25 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  35.34 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.07 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  36.97 
 
 
198 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  37.17 
 
 
214 aa  64.3  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  31.5 
 
 
204 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  31.5 
 
 
204 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  38.74 
 
 
211 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  36.73 
 
 
198 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  31.03 
 
 
205 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  34.33 
 
 
192 aa  60.8  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf516  hypothetical protein  36.45 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  30.51 
 
 
204 aa  60.5  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  31.19 
 
 
212 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  33.59 
 
 
198 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  31.2 
 
 
204 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  35.09 
 
 
212 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  32.56 
 
 
209 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  33.07 
 
 
213 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  38.46 
 
 
211 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  38.24 
 
 
208 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  30.48 
 
 
209 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  33.93 
 
 
194 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  30.71 
 
 
176 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  37.93 
 
 
215 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  33.93 
 
 
245 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  32.2 
 
 
204 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  32.46 
 
 
225 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.61 
 
 
208 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  33 
 
 
204 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  30.25 
 
 
210 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  30.97 
 
 
201 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  35.29 
 
 
196 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  29.41 
 
 
212 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  33.04 
 
 
194 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  31.36 
 
 
204 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  34.31 
 
 
213 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  32.76 
 
 
212 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0699  hypothetical protein  35.48 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0928683  normal  0.0143499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  31.36 
 
 
204 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  30.51 
 
 
204 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  32.81 
 
 
204 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  29.82 
 
 
213 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  30.63 
 
 
200 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  32.08 
 
 
206 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  33.65 
 
 
225 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  33.65 
 
 
195 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  32.38 
 
 
197 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  31 
 
 
197 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  30.93 
 
 
222 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 
211 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  31.43 
 
 
195 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  30.93 
 
 
200 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  31.13 
 
 
210 aa  53.9  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  31.82 
 
 
203 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0449  hypothetical protein  32.5 
 
 
194 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  33.64 
 
 
204 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  35.9 
 
 
214 aa  53.9  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  30.28 
 
 
218 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  43.66 
 
 
196 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  32.69 
 
 
195 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  32.38 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  31.63 
 
 
211 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  32.69 
 
 
195 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  32.69 
 
 
195 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  33 
 
 
201 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  40 
 
 
196 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  32.29 
 
 
195 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  31.63 
 
 
212 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0478  hypothetical protein  31.67 
 
 
194 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  32.35 
 
 
196 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  30.61 
 
 
199 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  33 
 
 
193 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  31.43 
 
 
194 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  32.35 
 
 
196 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  32.35 
 
 
290 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  31.43 
 
 
239 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1527  hypothetical protein  31.93 
 
 
194 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  35.29 
 
 
205 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  31.3 
 
 
213 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  32.35 
 
 
303 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0046  hypothetical protein  31.43 
 
 
191 aa  51.6  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  31.43 
 
 
204 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  31.19 
 
 
194 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  33.93 
 
 
203 aa  51.6  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  31.63 
 
 
211 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>