201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0454 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0454  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 
119 aa  238  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0586  hypothetical protein  49.58 
 
 
125 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.101078  decreased coverage  0.000251226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2485  hypothetical protein  46.36 
 
 
122 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  46.73 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  46.73 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  37.82 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  35.65 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  35.65 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  39.45 
 
 
209 aa  77  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  38.89 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  35.71 
 
 
198 aa  73.6  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  35.71 
 
 
198 aa  73.6  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  37.04 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  31.09 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  33.96 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  33.93 
 
 
198 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  32.76 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  33.02 
 
 
195 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  33.02 
 
 
195 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  33.02 
 
 
195 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  32.08 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  35.14 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  38.61 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  33.02 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  36.07 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  33.02 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  33.64 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  35.9 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  35.51 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  37.19 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  30.63 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  32.08 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  35.96 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  36.11 
 
 
212 aa  67.8  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0449  hypothetical protein  36.97 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  37.38 
 
 
213 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  29.41 
 
 
206 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  32.73 
 
 
290 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  33.94 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  33.94 
 
 
239 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  41 
 
 
208 aa  67.8  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  35.78 
 
 
205 aa  67.4  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  36.89 
 
 
207 aa  67.4  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  30.63 
 
 
245 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  31.09 
 
 
218 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1527  hypothetical protein  36.13 
 
 
194 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  35.29 
 
 
204 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0478  hypothetical protein  36.13 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  30.91 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  35.29 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  35.29 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  34.91 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  34.31 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  31.19 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  35.29 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  35.29 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  35.29 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  35.29 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  35.54 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  34.78 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  32.14 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  33.04 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  34.31 
 
 
204 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  64.3  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  35.64 
 
 
211 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  30.48 
 
 
199 aa  63.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0003  hypothetical protein  34.78 
 
 
210 aa  63.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  35.64 
 
 
211 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  35.64 
 
 
211 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  35.64 
 
 
211 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  35.64 
 
 
211 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  30.91 
 
 
197 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  35.64 
 
 
211 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  35.64 
 
 
211 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  36.54 
 
 
213 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  32.35 
 
 
204 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  30.77 
 
 
200 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  35 
 
 
205 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  35.64 
 
 
211 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0251  hypothetical protein  34.11 
 
 
193 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  32.08 
 
 
196 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  37.62 
 
 
214 aa  62  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  34.65 
 
 
209 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  30 
 
 
193 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  34.65 
 
 
212 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  31.9 
 
 
212 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  31.13 
 
 
196 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  36.45 
 
 
225 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  31.37 
 
 
204 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  32.79 
 
 
204 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  32.08 
 
 
197 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  34.65 
 
 
211 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1690  hypothetical protein  38.14 
 
 
172 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 
204 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  36 
 
 
211 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  30.63 
 
 
203 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  30.63 
 
 
203 aa  62  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  30.63 
 
 
203 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>