80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5726 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5726  methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 		 320 aa  642    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.799258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1185  metF protein-like  38.01 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1978  metfprotein-like  38.6 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1411  putative 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  39.22 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.959502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  38.95 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1029  5 10-methylenetetrahydrofolate reductase-like protein  39.3 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1675  hypothetical protein  40.22 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.723201  normal  0.26163 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5841  methylenetetrahydrofolate reductase  36.16 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6552  methylenetetrahydrofolate reductase  35.23 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03761  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  35.82 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2038  methylenetetrahydrofolate reductase  35.46 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2860  methylenetetrahydrofolate reductase  35.52 
 
 		 294 aa  150  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2669  methylenetetrahydrofolate reductase  33.46 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0298352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2988  methylenetetrahydrofolate reductase  33.46 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19720  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.67 
 
 		 274 aa  106  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0703  methylenetetrahydrofolate reductase  26.57 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2887  methylenetetrahydrofolate reductase  29.6 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1819  methylenetetrahydrofolate reductase  29.96 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0063  methylenetetrahydrofolate reductase  29.09 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4354  methylenetetrahydrofolate reductase  29.71 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.342919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11660  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.91 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1576  methylenetetrahydrofolate reductase  25.81 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00629171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0765  methylenetetrahydrofolate reductase  26.01 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.15 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1758  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.53 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.63 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0535  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.56 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.64764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0692  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.56 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000194482  unclonable  0.000000000127629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0459  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.95 
 
 		 281 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5281  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.13 
 
 		 281 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03550  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.5 
 
 		 281 aa  52.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5069  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.38 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2264  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.27 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.15 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2321  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.33 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.63 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0091  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase oxidoreductase protein  27.73 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0396  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.09 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2680  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.84 
 
 		 297 aa  49.3  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.883975  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3658  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.73 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3409  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.74 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110257  normal  0.0203193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.57 
 
 		 277 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.55 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302516  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3335  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.73 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1732  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.38 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000245457  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04820  methylenetetrahydrofolate reductase (NADPH), putative  28.32 
 
 		 617 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.999767  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4187  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.15 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.22 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.42 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1089  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  30 
 
 		 290 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0624  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.81 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4977  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.62 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.62 
 
 		 281 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0488  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0183  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.57 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.562647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.09 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83803  predicted protein  28.19 
 
 		 635 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.163002  decreased coverage  0.000293877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.09 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28431  predicted protein  33.33 
 
 		 634 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.120876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4850  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.62 
 
 		 281 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.21 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03524  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.54 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3044  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  22.67 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5126  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.71 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170004  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2517  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  26.75 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.52 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.08 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2393  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  22.95 
 
 		 284 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.235833  normal  0.350806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0188  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.19 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0201  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.19 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1122  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.03 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.476308 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0182  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.64 
 
 		 276 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344153  normal  0.0379106 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0180  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.73 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1105  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.42 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0497695  normal  0.0196735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4039  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.22 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1081  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.93 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0482  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.49 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1345  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.07 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  hitchhiker  0.000920684 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2667  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.11 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167357  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.74 
 
 		 305 aa  42.7  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112199  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>