28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1978 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1978  metfprotein-like  100 
 
 		 319 aa  651    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1185  metF protein-like  71.8 
 
 		 310 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  70.42 
 
 		 323 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1029  5 10-methylenetetrahydrofolate reductase-like protein  70.92 
 
 		 309 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1411  putative 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  70.59 
 
 		 309 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.959502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1675  hypothetical protein  67.77 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.723201  normal  0.26163 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5841  methylenetetrahydrofolate reductase  61.23 
 
 		 296 aa  350  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5726  methylenetetrahydrofolate reductase  38.6 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.799258 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6552  methylenetetrahydrofolate reductase  35.44 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03761  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.97 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2038  methylenetetrahydrofolate reductase  33.1 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2988  methylenetetrahydrofolate reductase  32.96 
 
 		 300 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2669  methylenetetrahydrofolate reductase  32.96 
 
 		 300 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0298352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2860  methylenetetrahydrofolate reductase  30.88 
 
 		 294 aa  136  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0703  methylenetetrahydrofolate reductase  26.81 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19720  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  33.65 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2887  methylenetetrahydrofolate reductase  26.48 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11660  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.11 
 
 		 292 aa  95.9  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0063  methylenetetrahydrofolate reductase  29.28 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4354  methylenetetrahydrofolate reductase  27.62 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.342919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1819  methylenetetrahydrofolate reductase  28 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1576  methylenetetrahydrofolate reductase  33.2 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00629171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0765  methylenetetrahydrofolate reductase  29.01 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2680  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.2 
 
 		 297 aa  49.7  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.883975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2517  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  24.32 
 
 		 276 aa  46.2  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.89 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1105  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.6 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0497695  normal  0.0196735 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1822  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.91 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00652514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>