25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1185 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1185  metF protein-like  100 
 
 		 310 aa  638    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1029  5 10-methylenetetrahydrofolate reductase-like protein  71.84 
 
 		 309 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1978  metfprotein-like  71.8 
 
 		 319 aa  451  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  71.2 
 
 		 323 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1411  putative 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  70.87 
 
 		 309 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.959502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1675  hypothetical protein  67.8 
 
 		 308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.723201  normal  0.26163 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5841  methylenetetrahydrofolate reductase  63.47 
 
 		 296 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5726  methylenetetrahydrofolate reductase  38.01 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.799258 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6552  methylenetetrahydrofolate reductase  34.93 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2860  methylenetetrahydrofolate reductase  29.5 
 
 		 294 aa  139  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2038  methylenetetrahydrofolate reductase  28.94 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03761  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  30.04 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2988  methylenetetrahydrofolate reductase  29.96 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2669  methylenetetrahydrofolate reductase  29.96 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0298352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2887  methylenetetrahydrofolate reductase  29.71 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11660  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.94 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19720  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.77 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0703  methylenetetrahydrofolate reductase  25.47 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0063  methylenetetrahydrofolate reductase  31.22 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1819  methylenetetrahydrofolate reductase  23.88 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4354  methylenetetrahydrofolate reductase  25.83 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.342919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1576  methylenetetrahydrofolate reductase  27.06 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00629171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0765  methylenetetrahydrofolate reductase  30.23 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1822  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  22.12 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00652514  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0183  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.37 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.562647  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>