229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1819 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1819  methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
289 aa  574  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2887  methylenetetrahydrofolate reductase  40.3 
 
 
310 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11660  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  37.05 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19720  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  42.23 
 
 
274 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4354  methylenetetrahydrofolate reductase  44.57 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.342919  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0765  methylenetetrahydrofolate reductase  39.02 
 
 
324 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1576  methylenetetrahydrofolate reductase  38.24 
 
 
313 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00629171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0063  methylenetetrahydrofolate reductase  35.34 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6552  methylenetetrahydrofolate reductase  32.63 
 
 
292 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137851  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03761  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  30.04 
 
 
311 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2669  methylenetetrahydrofolate reductase  28.17 
 
 
300 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0298352  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2988  methylenetetrahydrofolate reductase  28.17 
 
 
300 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5726  methylenetetrahydrofolate reductase  29.96 
 
 
320 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.799258 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2860  methylenetetrahydrofolate reductase  28.8 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1675  hypothetical protein  29.58 
 
 
308 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.723201  normal  0.26163 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2038  methylenetetrahydrofolate reductase  26.83 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.3 
 
 
323 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5841  methylenetetrahydrofolate reductase  27.73 
 
 
296 aa  85.9  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1411  putative 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.41 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.959502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1029  5 10-methylenetetrahydrofolate reductase-like protein  26.06 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1185  metF protein-like  23.88 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1978  metfprotein-like  28 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0703  methylenetetrahydrofolate reductase  25 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1572  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  30.77 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3307  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  31.7 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.29 
 
 
276 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0599  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  31.1 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0620  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  31.1 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1279  methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  25.75 
 
 
313 aa  60.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  33.12 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.0231956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0182  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.15 
 
 
276 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344153  normal  0.0379106 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3083  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.98 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0275518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3756  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.97 
 
 
276 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0162  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.48 
 
 
302 aa  59.3  0.00000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.96 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3377  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.78 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1367  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.1 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0832  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.59 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.32 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2916  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.28 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0256  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.46 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0396  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.32 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2833  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.46 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355135  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0188  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.78 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.06 
 
 
290 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0274  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.46 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320742  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0201  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.72 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3250  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.49 
 
 
305 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.670776  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2840  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.9 
 
 
276 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.223296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.9 
 
 
276 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0180  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.8 
 
 
276 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.9 
 
 
276 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1703  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.9 
 
 
276 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.708829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3836  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.9 
 
 
276 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139843  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.9 
 
 
276 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3136  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.9 
 
 
276 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0091  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase oxidoreductase protein  27.56 
 
 
276 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2651  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  30.89 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3163  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.54 
 
 
276 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02690  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.3 
 
 
313 aa  56.2  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1800  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.08 
 
 
319 aa  55.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00836957  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1345  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.04 
 
 
308 aa  55.8  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  hitchhiker  0.000920684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3800  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  29.81 
 
 
318 aa  55.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  30.6 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0642  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.88 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  33.74 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0522  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.08 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1758  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.69 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0106  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  26.61 
 
 
359 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0491  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.76 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28431  predicted protein  24.23 
 
 
634 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.120876  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.52 
 
 
354 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0768874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.31 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1389  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.33 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.695264  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1765  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  30.96 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294804  normal  0.0134903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2264  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.35 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3477  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.65 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112199  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1105  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.37 
 
 
293 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0497695  normal  0.0196735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.71 
 
 
281 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23510  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.38 
 
 
286 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0624  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.54 
 
 
296 aa  52.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0618  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  31.94 
 
 
295 aa  52.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3540  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  31.47 
 
 
295 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.94 
 
 
282 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0234  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.6 
 
 
318 aa  52.8  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0566  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.88 
 
 
295 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0538  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.88 
 
 
295 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0562  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.88 
 
 
295 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3658  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.73 
 
 
276 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3774  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.88 
 
 
295 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.76 
 
 
289 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4054  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.8 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0183  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.75 
 
 
274 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.562647  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0142  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.22 
 
 
298 aa  51.6  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000167053  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2525  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.1 
 
 
316 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000354745  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3335  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.73 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3547  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  30.72 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2367  Deleted entry  25.34 
 
 
323 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1089  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.38 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03550  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  30.28 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>