68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0703 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0703  methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2669  methylenetetrahydrofolate reductase  29.63 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0298352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2988  methylenetetrahydrofolate reductase  29.63 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2038  methylenetetrahydrofolate reductase  30.08 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03761  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.26 
 
 		 311 aa  148  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2860  methylenetetrahydrofolate reductase  33.46 
 
 		 294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6552  methylenetetrahydrofolate reductase  29.86 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1978  metfprotein-like  26.81 
 
 		 319 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5841  methylenetetrahydrofolate reductase  25.82 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1411  putative 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.09 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.959502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.09 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5726  methylenetetrahydrofolate reductase  26.57 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.799258 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1029  5 10-methylenetetrahydrofolate reductase-like protein  24.73 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1185  metF protein-like  25.47 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1675  hypothetical protein  25.37 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.723201  normal  0.26163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1819  methylenetetrahydrofolate reductase  25 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0063  methylenetetrahydrofolate reductase  27.03 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2887  methylenetetrahydrofolate reductase  25 
 
 		 310 aa  72  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4354  methylenetetrahydrofolate reductase  26.41 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.342919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11660  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1576  methylenetetrahydrofolate reductase  26.1 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00629171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19720  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.84 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0765  methylenetetrahydrofolate reductase  26.1 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4187  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.89 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.57 
 
 		 314 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.424699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0201  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.81 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.26 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3734  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.88 
 
 		 298 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0180  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.18 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1765  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.19 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294804  normal  0.0134903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0188  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.81 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.6 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0274  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.67 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.7 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.0231956 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2833  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.67 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355135  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0256  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.67 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05883  Methylenetetrahydrofolate reductase (EC 1.5.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B0P7]  32.43 
 
 		 627 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.89852  normal  0.953808 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2517  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  28.4 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3377  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.34 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3540  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.13 
 
 		 295 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.91 
 
 		 294 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0182  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.34 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344153  normal  0.0379106 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3034  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.79 
 
 		 291 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3955  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.49 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2525  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  22.97 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000354745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.71 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.921353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3836  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.05 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139843  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0091  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase oxidoreductase protein  25.11 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2840  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.05 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.223296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3136  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.05 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.05 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1703  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.05 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.708829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.05 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.05 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.74 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1105  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.22 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0497695  normal  0.0196735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2862  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.99 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3163  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  22.68 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3169  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.04 
 
 		 296 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0364  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.66 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3756  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.02 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1122  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.61 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.476308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1992  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  21.74 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000776799  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3789  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.71 
 
 		 299 aa  42.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7060  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.22 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.377124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1406  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.24 
 
 		 303 aa  42.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30471  predicted protein  26.14 
 
 		 376 aa  42  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.839927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>