32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2769 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 		 323 aa  656    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1411  putative 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  99.68 
 
 		 309 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.959502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1029  5 10-methylenetetrahydrofolate reductase-like protein  95.79 
 
 		 309 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1185  metF protein-like  71.2 
 
 		 310 aa  451  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1978  metfprotein-like  70.42 
 
 		 319 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1675  hypothetical protein  64.04 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.723201  normal  0.26163 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5841  methylenetetrahydrofolate reductase  61.4 
 
 		 296 aa  355  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5726  methylenetetrahydrofolate reductase  38.95 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.799258 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6552  methylenetetrahydrofolate reductase  34.78 
 
 		 292 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2038  methylenetetrahydrofolate reductase  32.48 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03761  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.43 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2669  methylenetetrahydrofolate reductase  32.17 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0298352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2988  methylenetetrahydrofolate reductase  32.17 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2860  methylenetetrahydrofolate reductase  31.23 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2887  methylenetetrahydrofolate reductase  31.29 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11660  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  30.18 
 
 		 292 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0703  methylenetetrahydrofolate reductase  25.09 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19720  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.37 
 
 		 274 aa  96.3  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1576  methylenetetrahydrofolate reductase  29.49 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00629171  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1819  methylenetetrahydrofolate reductase  26.3 
 
 		 289 aa  86.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0063  methylenetetrahydrofolate reductase  29.69 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0765  methylenetetrahydrofolate reductase  29.13 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4354  methylenetetrahydrofolate reductase  27.57 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.342919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2393  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.47 
 
 		 284 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.235833  normal  0.350806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0183  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.57 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.562647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2321  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.87 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0692  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.1 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000194482  unclonable  0.000000000127629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0535  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.1 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.64764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2680  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.85 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.883975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.63 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.82 
 
 		 288 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  34.82 
 
 		 288 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>