136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2860 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2860  methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 
294 aa  593  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2988  methylenetetrahydrofolate reductase  52.46 
 
 
300 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2669  methylenetetrahydrofolate reductase  52.46 
 
 
300 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0298352  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03761  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  52.94 
 
 
311 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2038  methylenetetrahydrofolate reductase  52.55 
 
 
289 aa  296  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6552  methylenetetrahydrofolate reductase  35.14 
 
 
292 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137851  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0703  methylenetetrahydrofolate reductase  33.46 
 
 
274 aa  158  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5726  methylenetetrahydrofolate reductase  35.52 
 
 
320 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.799258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1978  metfprotein-like  30.88 
 
 
319 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5841  methylenetetrahydrofolate reductase  31.29 
 
 
296 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1185  metF protein-like  29.5 
 
 
310 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  31.23 
 
 
323 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1411  putative 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  31.23 
 
 
309 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.959502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1675  hypothetical protein  32.1 
 
 
308 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.723201  normal  0.26163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1029  5 10-methylenetetrahydrofolate reductase-like protein  31.58 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2887  methylenetetrahydrofolate reductase  30.36 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11660  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.88 
 
 
292 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19720  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  36.27 
 
 
274 aa  108  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4354  methylenetetrahydrofolate reductase  32.79 
 
 
273 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.342919  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1819  methylenetetrahydrofolate reductase  28.8 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1576  methylenetetrahydrofolate reductase  30.5 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00629171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0765  methylenetetrahydrofolate reductase  30 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0063  methylenetetrahydrofolate reductase  28.7 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0692  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  31.46 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000194482  unclonable  0.000000000127629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0535  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  31.46 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.64764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4919  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.41 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.65 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3540  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.7 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7060  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.34 
 
 
305 aa  59.3  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.377124  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2028  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.5 
 
 
305 aa  58.9  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1122  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.06 
 
 
309 aa  58.9  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.476308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1765  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.83 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294804  normal  0.0134903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0284  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.34 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.819527  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2401  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.14 
 
 
300 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.0231956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0614  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.78 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.502015  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1822  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.53 
 
 
285 aa  56.6  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00652514  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3288  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  25 
 
 
286 aa  56.2  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16886  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0396  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.1 
 
 
282 aa  55.8  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28431  predicted protein  25.12 
 
 
634 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.120876  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3658  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.56 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3335  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.56 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2925  methylenetetrahydrofolate reductase  29 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0183  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.9 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.562647  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.23 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3544  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.49 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.373461 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0191  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.09 
 
 
280 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2833  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.98 
 
 
276 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0274  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.98 
 
 
276 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320742  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1639  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  30.1 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0172  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.36 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0654  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.29 
 
 
283 aa  53.1  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1758  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.84 
 
 
295 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4058  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.6 
 
 
282 aa  53.1  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.450215  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0491  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.85 
 
 
276 aa  52.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0256  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.3 
 
 
276 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0091  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase oxidoreductase protein  23.84 
 
 
276 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2539  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.54 
 
 
281 aa  52.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0456939  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0364  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.75 
 
 
304 aa  52.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1992  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  30.49 
 
 
291 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000776799  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0201  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.51 
 
 
276 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0620  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.57 
 
 
279 aa  52.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0599  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.57 
 
 
279 aa  52.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05883  Methylenetetrahydrofolate reductase (EC 1.5.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B0P7]  25.13 
 
 
627 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.89852  normal  0.953808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0188  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.51 
 
 
276 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0182  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.49 
 
 
276 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344153  normal  0.0379106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4365  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  30.88 
 
 
306 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0898114  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4187  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  22.33 
 
 
292 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0215  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.11 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.474341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4130  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.66 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2264  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.02 
 
 
289 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07390  methylenetetrahydrofolate reductase (NADPH), putative  31.58 
 
 
633 aa  50.4  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.497264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2680  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.49 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.883975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3377  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.91 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1026  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.34 
 
 
288 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2438  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.07 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24213  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3302  methylenetetrahydrofolate reductase  25.77 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.247895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2124  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.76 
 
 
305 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.737852  normal  0.432021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.9 
 
 
277 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71674  predicted protein  27.66 
 
 
613 aa  49.7  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.506465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1600  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.57 
 
 
310 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.143664 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2840  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.09 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.223296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0055  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.09 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3163  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.09 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1089  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  22.7 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3415  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.09 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1703  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.09 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.708829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3836  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.09 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139843  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3917  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.09 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3136  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.09 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1881  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.56 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0180  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.62 
 
 
276 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04353  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.68 
 
 
275 aa  49.3  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4223  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.26 
 
 
295 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480979  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2517  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  26.38 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2393  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.02 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.235833  normal  0.350806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3034  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.5 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0946  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  26.16 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000110385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5281  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.1 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3208  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.33 
 
 
313 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0035  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.7 
 
 
312 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>