25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1675 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1675  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  616  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.723201  normal  0.26163 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1185  metF protein-like  67.8 
 
 
310 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1978  metfprotein-like  67.44 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.04 
 
 
323 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1029  5 10-methylenetetrahydrofolate reductase-like protein  65.19 
 
 
309 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1411  putative 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  64.04 
 
 
309 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.959502 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5841  methylenetetrahydrofolate reductase  58.42 
 
 
296 aa  346  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5726  methylenetetrahydrofolate reductase  40.22 
 
 
320 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.799258 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6552  methylenetetrahydrofolate reductase  36.3 
 
 
292 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137851  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03761  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.86 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2860  methylenetetrahydrofolate reductase  31.73 
 
 
294 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2988  methylenetetrahydrofolate reductase  31.14 
 
 
300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2669  methylenetetrahydrofolate reductase  31.14 
 
 
300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0298352  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2038  methylenetetrahydrofolate reductase  30.99 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2887  methylenetetrahydrofolate reductase  31.82 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11660  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  30.14 
 
 
292 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0063  methylenetetrahydrofolate reductase  31.16 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19720  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.6 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1819  methylenetetrahydrofolate reductase  30.28 
 
 
289 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0703  methylenetetrahydrofolate reductase  25.37 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0765  methylenetetrahydrofolate reductase  27.63 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1576  methylenetetrahydrofolate reductase  26.73 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00629171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4354  methylenetetrahydrofolate reductase  27.64 
 
 
273 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.342919  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  31.97 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2393  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.71 
 
 
284 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.235833  normal  0.350806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>