28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1029 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1029  5 10-methylenetetrahydrofolate reductase-like protein  100 
 
 		 309 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  95.79 
 
 		 323 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1411  putative 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  96.12 
 
 		 309 aa  594  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.959502 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1185  metF protein-like  71.84 
 
 		 310 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1978  metfprotein-like  70.92 
 
 		 319 aa  432  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1675  hypothetical protein  65.19 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.723201  normal  0.26163 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5841  methylenetetrahydrofolate reductase  62.23 
 
 		 296 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5726  methylenetetrahydrofolate reductase  39.3 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.799258 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6552  methylenetetrahydrofolate reductase  34.42 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2038  methylenetetrahydrofolate reductase  32.98 
 
 		 289 aa  139  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2860  methylenetetrahydrofolate reductase  31.58 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03761  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  31.94 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2669  methylenetetrahydrofolate reductase  32.17 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0298352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2988  methylenetetrahydrofolate reductase  32.17 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2887  methylenetetrahydrofolate reductase  28.87 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11660  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.62 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0703  methylenetetrahydrofolate reductase  24.73 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19720  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.97 
 
 		 274 aa  96.3  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0063  methylenetetrahydrofolate reductase  29.69 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1576  methylenetetrahydrofolate reductase  29.17 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00629171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0765  methylenetetrahydrofolate reductase  29.13 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1819  methylenetetrahydrofolate reductase  26.06 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4354  methylenetetrahydrofolate reductase  25.91 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.342919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0183  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.57 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.562647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2321  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  32.87 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0692  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.71 
 
 		 272 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000194482  unclonable  0.000000000127629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0535  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.71 
 
 		 272 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.64764  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2393  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.71 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.235833  normal  0.350806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>