106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2921 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2921  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  100 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.916972  hitchhiker  0.000246465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0335  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  64.94 
 
 		 152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0978  Fe-S cluster domain-containing protein  61.04 
 
 		 152 aa  189  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0863  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  46.03 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1369  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40.3 
 
 		 476 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.78916  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0211  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.9 
 
 		 489 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.78 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.505071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0560  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.58 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1721  hypothetical protein  51.79 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0287  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.07 
 
 		 470 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0345  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  46.99 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1427  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.78 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0454615  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1678  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  42.65 
 
 		 457 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.910925  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0800  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  41.18 
 
 		 457 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0222  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  42.03 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.498309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2213  putative Fe-S cluster  45.61 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0469762  hitchhiker  0.00385704 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0686  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  37.5 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0199  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  36.76 
 
 		 469 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0429  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  36.76 
 
 		 469 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.400713  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1288  Fe-S cluster domain-containing protein  43.86 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.323345  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0306  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40.58 
 
 		 457 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.135337  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2880  Fe-S cluster domain-containing protein  44.68 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0633  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0337  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.44 
 
 		 446 aa  50.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1288  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  35.42 
 
 		 346 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3600  Fe-S cluster domain-containing protein  42.55 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3183  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  34.43 
 
 		 446 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0285  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  32.82 
 
 		 340 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0862622  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1402  Fe-S cluster domain-containing protein  44.62 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0872  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.3 
 
 		 443 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0634  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40.82 
 
 		 448 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.99963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  32.26 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.56 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.150574  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1274  Fe-S cluster domain-containing protein  38.75 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0665  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40.82 
 
 		 448 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0699  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40.82 
 
 		 448 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2564  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.3 
 
 		 450 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3405  Fe-S cluster domain protein  38.3 
 
 		 266 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1194  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40.43 
 
 		 444 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521851  normal  0.0279063 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0682  Fe-S cluster domain-containing protein  41.54 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_603  carbon-monoxide dehydrogenase, corrinoid/iron-sulfur protein, gamma subunit  40.82 
 
 		 448 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2796  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.3 
 
 		 440 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  25.48 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  25.48 
 
 		 194 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1272  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  37.78 
 
 		 442 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0937  ferredoxin  30.11 
 
 		 276 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1201  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40.48 
 
 		 446 aa  44.3  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1972  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.53 
 
 		 229 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.555312 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2096  ferredoxin  30.53 
 
 		 291 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1047  ferredoxin  28.28 
 
 		 248 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  28.97 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1006  ferredoxin  25.95 
 
 		 268 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.110987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5668  ferredoxin  29.59 
 
 		 334 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0971  ferredoxin  30 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2341  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  26.04 
 
 		 232 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0747882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1023  ferredoxin  31.31 
 
 		 290 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0284  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.85 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.419432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0842  ferredoxin  31.31 
 
 		 290 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.736914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1176  ferredoxin  31.31 
 
 		 290 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1184  ferredoxin  31.31 
 
 		 290 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0306  ferredoxin  31.31 
 
 		 290 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0156  Fe-S cluster domain-containing protein  38.33 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3619  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29.29 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111565  normal  0.0672308 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01788  ferredoxin  28.57 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102822  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  36.17 
 
 		 444 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2627  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29.89 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3052  Fe-S cluster domain protein  38.64 
 
 		 266 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.471844  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1930  ferredoxin  31.31 
 
 		 316 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2794  hypothetical protein  27.04 
 
 		 204 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1337  ferredoxin  31.31 
 
 		 316 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1174  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  25.77 
 
 		 209 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1714  ferredoxin  28.57 
 
 		 342 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2326  ferredoxin  28.57 
 
 		 342 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  29.91 
 
 		 199 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  27.96 
 
 		 195 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1754  ferredoxin  25.26 
 
 		 139 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0464  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  28.44 
 
 		 228 aa  41.6  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0463817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1680  ferredoxin  25.26 
 
 		 139 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2928  ferredoxin  27.37 
 
 		 137 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2940  hypothetical protein  27.04 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  30.21 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1015  ferredoxin  30.21 
 
 		 279 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0219422  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  28.97 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  28.97 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0951  ferredoxin  30.61 
 
 		 320 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2349  ferredoxin  28.57 
 
 		 306 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108055 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  29.91 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2170  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  28.57 
 
 		 221 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  29.91 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  29.91 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  28.04 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1498  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  26.8 
 
 		 230 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2245  ferredoxin  28.57 
 
 		 341 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.666336 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1786  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.11 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  30.23 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2365  ferredoxin  28.57 
 
 		 339 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  29.91 
 
 		 193 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0573  hypothetical protein  32.95 
 
 		 198 aa  41.2  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.575358  decreased coverage  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  29.91 
 
 		 204 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1236  ferredoxin  28.57 
 
 		 279 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.41049 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>