47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1288 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1288  Fe-S cluster domain-containing protein  100 
 
 		 262 aa  535  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.323345  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1721  hypothetical protein  60.62 
 
 		 265 aa  345  4e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1724  hypothetical protein  58.11 
 
 		 82 aa  99.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2213  putative Fe-S cluster  33.73 
 
 		 171 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0469762  hitchhiker  0.00385704 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3600  Fe-S cluster domain-containing protein  30.38 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1369  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40.3 
 
 		 476 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.78916  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2880  Fe-S cluster domain-containing protein  27.78 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0863  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.46 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0686  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  43.94 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1723  hypothetical protein  41.56 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0429  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.46 
 
 		 469 aa  62.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.400713  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0199  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.46 
 
 		 469 aa  62.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0335  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  41.38 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0287  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  42.37 
 
 		 470 aa  59.3  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0978  Fe-S cluster domain-containing protein  41.67 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2921  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  43.86 
 
 		 154 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.916972  hitchhiker  0.000246465 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0211  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  34.43 
 
 		 489 aa  54.3  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1678  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.71 
 
 		 457 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.910925  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0222  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.71 
 
 		 457 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.498309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0872  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  43.24 
 
 		 443 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0337  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  39.53 
 
 		 446 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0800  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.71 
 
 		 457 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1272  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  37.84 
 
 		 442 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2564  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  42.55 
 
 		 450 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0112  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  51.22 
 
 		 452 aa  49.7  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0634  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.19 
 
 		 448 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.99963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1194  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  39.53 
 
 		 444 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521851  normal  0.0279063 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  42.86 
 
 		 444 aa  48.9  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3183  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.78 
 
 		 446 aa  48.9  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1201  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.95 
 
 		 446 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0699  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  41.86 
 
 		 448 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_603  carbon-monoxide dehydrogenase, corrinoid/iron-sulfur protein, gamma subunit  41.86 
 
 		 448 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0665  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  41.86 
 
 		 448 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0306  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  35.48 
 
 		 457 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.135337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2796  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.95 
 
 		 440 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3405  Fe-S cluster domain protein  37.78 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0969  Fe-S cluster domain-containing protein  37.31 
 
 		 118 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1721  Fe-S cluster domain protein  32.56 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3052  Fe-S cluster domain protein  30.51 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.471844  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  36.21 
 
 		 117 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 120 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  36.21 
 
 		 117 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0156  Fe-S cluster domain-containing protein  38.18 
 
 		 238 aa  43.1  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0683  Fe-S cluster domain-containing protein  40.38 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 123 aa  42.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1402  Fe-S cluster domain-containing protein  32.76 
 
 		 219 aa  42  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0287  hypothetical protein  25.53 
 
 		 95 aa  42  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>