53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3405 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3405  Fe-S cluster domain protein  100 
 
 
266 aa  549  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3052  Fe-S cluster domain protein  60 
 
 
266 aa  358  5e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.471844  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1721  Fe-S cluster domain protein  54.72 
 
 
266 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1915  Fe-S cluster domain-containing protein  47.92 
 
 
270 aa  271  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.825749  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1535  Fe-S cluster domain-containing protein  24.36 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.02631  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_603  carbon-monoxide dehydrogenase, corrinoid/iron-sulfur protein, gamma subunit  44.9 
 
 
448 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2796  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  51.02 
 
 
440 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0665  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.9 
 
 
448 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0699  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.9 
 
 
448 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3721  hypothetical protein  25.57 
 
 
200 aa  58.9  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000218431  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0634  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  51.16 
 
 
448 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.99963  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0633  hypothetical protein  25.42 
 
 
214 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0660208  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1369  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  52.5 
 
 
476 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.78916  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0337  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  53.49 
 
 
446 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1614  hypothetical protein  25.56 
 
 
217 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000204852  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2564  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.83 
 
 
450 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3183  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  41.67 
 
 
446 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1201  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  54.76 
 
 
446 aa  56.2  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  55.32 
 
 
444 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2213  putative Fe-S cluster  50 
 
 
171 aa  55.8  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0469762  hitchhiker  0.00385704 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0872  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  50 
 
 
443 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0335  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  48.94 
 
 
152 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1990  hypothetical protein  22.94 
 
 
211 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0256208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2880  Fe-S cluster domain-containing protein  43.75 
 
 
173 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3600  Fe-S cluster domain-containing protein  47.83 
 
 
173 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0686  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.5 
 
 
476 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2562  hypothetical protein  25.38 
 
 
201 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1693  hypothetical protein  21.69 
 
 
204 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1272  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  42.86 
 
 
442 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000364956  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0199  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.44 
 
 
469 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287834  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0429  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.44 
 
 
469 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.400713  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_602  hypothetical protein  23.24 
 
 
214 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1194  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  50 
 
 
444 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521851  normal  0.0279063 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0211  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  22.08 
 
 
489 aa  48.9  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0112  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  43.14 
 
 
452 aa  48.9  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0664  hypothetical protein  23.24 
 
 
214 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0446  hypothetical protein  27.78 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0698  hypothetical protein  23.24 
 
 
214 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0863  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  36.51 
 
 
468 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0978  Fe-S cluster domain-containing protein  38.89 
 
 
152 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1288  Fe-S cluster domain-containing protein  37.78 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.323345  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0222  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45 
 
 
457 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.498309  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1678  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45 
 
 
457 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.910925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4098  hypothetical protein  20.74 
 
 
218 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0800  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  42.5 
 
 
457 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2921  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  38.3 
 
 
154 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.916972  hitchhiker  0.000246465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0287  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  39.13 
 
 
470 aa  45.8  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1302  hypothetical protein  23.18 
 
 
203 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1269  hypothetical protein  21.01 
 
 
209 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2548  hypothetical protein  25.15 
 
 
217 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.477567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1721  hypothetical protein  41.46 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50970  Electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  29.33 
 
 
174 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0817561  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0306  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45 
 
 
457 aa  43.5  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.135337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>