17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1990 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1990  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  428  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0256208  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_602  hypothetical protein  29.33 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0698  hypothetical protein  29.33 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0664  hypothetical protein  29.33 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0633  hypothetical protein  29.01 
 
 
214 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0660208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3052  Fe-S cluster domain protein  22.16 
 
 
266 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.471844  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1614  hypothetical protein  28.48 
 
 
217 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000204852  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1721  Fe-S cluster domain protein  22.6 
 
 
266 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3405  Fe-S cluster domain protein  22.94 
 
 
266 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1302  hypothetical protein  28.45 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0446  hypothetical protein  30.46 
 
 
205 aa  48.9  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1535  Fe-S cluster domain-containing protein  36.17 
 
 
276 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.02631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1269  hypothetical protein  24.03 
 
 
209 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3721  hypothetical protein  27.12 
 
 
200 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000218431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2548  hypothetical protein  23.38 
 
 
217 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.477567 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4098  hypothetical protein  26.92 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1159  hypothetical protein  28.07 
 
 
214 aa  41.2  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000681743  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>