47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1535 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1535  Fe-S cluster domain-containing protein  100 
 
 
276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.02631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3405  Fe-S cluster domain protein  24 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1915  Fe-S cluster domain-containing protein  23.16 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.825749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0446  hypothetical protein  28.06 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3052  Fe-S cluster domain protein  22.1 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.471844  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1721  Fe-S cluster domain protein  22.31 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4098  hypothetical protein  28.82 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1159  hypothetical protein  32.39 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000681743  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3721  hypothetical protein  27.01 
 
 
200 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000218431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1990  hypothetical protein  40.43 
 
 
211 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0256208  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1201  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  52.17 
 
 
446 aa  55.8  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2562  hypothetical protein  22.12 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221792  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0800  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.65 
 
 
457 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1693  hypothetical protein  27.89 
 
 
204 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0287  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  27.14 
 
 
470 aa  52.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2796  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.45 
 
 
440 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0222  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.65 
 
 
457 aa  52.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.498309  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0664  hypothetical protein  26.95 
 
 
214 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0698  hypothetical protein  26.95 
 
 
214 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0634  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  46.67 
 
 
448 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.99963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1302  hypothetical protein  25 
 
 
203 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234521 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_602  hypothetical protein  26.95 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1678  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.65 
 
 
457 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.910925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2564  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  46.94 
 
 
450 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1194  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  50 
 
 
444 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521851  normal  0.0279063 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  50 
 
 
444 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1272  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.61 
 
 
442 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000364956  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0633  hypothetical protein  23.96 
 
 
214 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0660208  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0872  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  46.94 
 
 
443 aa  48.9  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0211  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  42.86 
 
 
489 aa  48.9  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0199  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  33.33 
 
 
469 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287834  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0112  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  49.06 
 
 
452 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0429  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  33.33 
 
 
469 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.400713  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1369  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.06 
 
 
476 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.78916  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0337  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  46.94 
 
 
446 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_603  carbon-monoxide dehydrogenase, corrinoid/iron-sulfur protein, gamma subunit  39.22 
 
 
448 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1269  hypothetical protein  27.89 
 
 
209 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388036  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0699  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  39.22 
 
 
448 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0665  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  39.22 
 
 
448 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3183  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  42.86 
 
 
446 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0306  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  43.48 
 
 
457 aa  45.8  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.135337  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0686  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  48.89 
 
 
476 aa  45.4  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2940  hypothetical protein  36.36 
 
 
204 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0335  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  46.51 
 
 
152 aa  43.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0978  Fe-S cluster domain-containing protein  44.44 
 
 
152 aa  42.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3600  Fe-S cluster domain-containing protein  54.05 
 
 
173 aa  42  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2213  putative Fe-S cluster  42.86 
 
 
171 aa  42  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0469762  hitchhiker  0.00385704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>