42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1915 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1915  Fe-S cluster domain-containing protein  100 
 
 
270 aa  560  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.825749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3052  Fe-S cluster domain protein  45.11 
 
 
266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.471844  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3405  Fe-S cluster domain protein  47.92 
 
 
266 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1721  Fe-S cluster domain protein  43.98 
 
 
266 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1535  Fe-S cluster domain-containing protein  23.16 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.02631  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0633  hypothetical protein  24.56 
 
 
214 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0660208  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0446  hypothetical protein  31.91 
 
 
205 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0222  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  52.38 
 
 
457 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.498309  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3721  hypothetical protein  24.46 
 
 
200 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000218431  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1678  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  52.38 
 
 
457 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.910925  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0800  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  50 
 
 
457 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_602  hypothetical protein  24.31 
 
 
214 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2562  hypothetical protein  24.41 
 
 
201 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221792  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1159  hypothetical protein  21.89 
 
 
214 aa  52.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000681743  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0872  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.65 
 
 
443 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1369  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.65 
 
 
476 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.78916  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.64 
 
 
444 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0664  hypothetical protein  23.76 
 
 
214 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1302  hypothetical protein  26.67 
 
 
203 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234521 
 
 
-
 
NC_002936  DET0698  hypothetical protein  23.76 
 
 
214 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2213  putative Fe-S cluster  46.67 
 
 
171 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0469762  hitchhiker  0.00385704 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4098  hypothetical protein  20.5 
 
 
218 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1272  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.45 
 
 
442 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000364956  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0211  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40.91 
 
 
489 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1693  hypothetical protein  25.42 
 
 
204 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2880  Fe-S cluster domain-containing protein  33.96 
 
 
173 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1194  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  37.5 
 
 
444 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521851  normal  0.0279063 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0337  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  42.22 
 
 
446 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3183  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.44 
 
 
446 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0634  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  41.3 
 
 
448 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.99963  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3600  Fe-S cluster domain-containing protein  34.55 
 
 
173 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0306  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.24 
 
 
457 aa  46.6  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.135337  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2564  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.65 
 
 
450 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2796  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  41.18 
 
 
440 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1614  hypothetical protein  26.67 
 
 
217 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000204852  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2548  hypothetical protein  23.93 
 
 
217 aa  45.4  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.477567 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_603  carbon-monoxide dehydrogenase, corrinoid/iron-sulfur protein, gamma subunit  35.29 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0335  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  35.19 
 
 
152 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0686  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.74 
 
 
476 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0699  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  32.35 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0665  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  32.35 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1201  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45 
 
 
446 aa  42.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>