60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3600 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3600  Fe-S cluster domain-containing protein  100 
 
 		 173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2880  Fe-S cluster domain-containing protein  58.72 
 
 		 173 aa  225  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2213  putative Fe-S cluster  35.17 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0469762  hitchhiker  0.00385704 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1288  Fe-S cluster domain-containing protein  30.38 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.323345  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0872  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  49.06 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1369  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  52.27 
 
 		 476 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.78916  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2564  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  52 
 
 		 450 aa  60.8  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3183  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  46.94 
 
 		 446 aa  58.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1272  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  45.83 
 
 		 442 aa  57.8  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_603  carbon-monoxide dehydrogenase, corrinoid/iron-sulfur protein, gamma subunit  44.23 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0337  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  51.16 
 
 		 446 aa  55.1  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0634  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.23 
 
 		 448 aa  54.7  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.99963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2796  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  48 
 
 		 440 aa  54.7  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0665  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.23 
 
 		 448 aa  54.7  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0699  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  44.23 
 
 		 448 aa  54.7  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1721  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  54.3  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3405  Fe-S cluster domain protein  47.83 
 
 		 266 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  42.31 
 
 		 444 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0686  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  43.48 
 
 		 476 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0429  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40 
 
 		 469 aa  51.2  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.400713  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0199  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40 
 
 		 469 aa  51.2  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1194  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  38.46 
 
 		 444 aa  50.8  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521851  normal  0.0279063 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3052  Fe-S cluster domain protein  38.89 
 
 		 266 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.471844  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2921  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  42.55 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.916972  hitchhiker  0.000246465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0863  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40 
 
 		 468 aa  48.9  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228228  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0335  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  45.45 
 
 		 152 aa  48.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1201  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.37 
 
 		 446 aa  47.8  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0211  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40 
 
 		 489 aa  48.1  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0800  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  35.71 
 
 		 457 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1678  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  37.5 
 
 		 457 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.910925  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0156  Fe-S cluster domain-containing protein  48.84 
 
 		 238 aa  47  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0222  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  35.71 
 
 		 457 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.498309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1915  Fe-S cluster domain-containing protein  34.55 
 
 		 270 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.825749  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0306  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  37.5 
 
 		 457 aa  45.8  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.135337  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0287  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  40 
 
 		 470 aa  45.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0112  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit gamma  47.37 
 
 		 452 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0682  Fe-S cluster domain-containing protein  44.19 
 
 		 219 aa  44.7  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0978  Fe-S cluster domain-containing protein  41.67 
 
 		 152 aa  44.3  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  36.51 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1402  Fe-S cluster domain-containing protein  44.19 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1791  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.94 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445554  hitchhiker  0.00820964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2400  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB  38.81 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.942423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  39.06 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1274  Fe-S cluster domain-containing protein  44.19 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  37.1 
 
 		 193 aa  42  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1086  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.81 
 
 		 286 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0696553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1535  Fe-S cluster domain-containing protein  54.05 
 
 		 276 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.02631  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  37.1 
 
 		 197 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  37.1 
 
 		 193 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  37.1 
 
 		 193 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0499  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  37.1 
 
 		 268 aa  41.6  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156783  hitchhiker  0.0000260777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  37.1 
 
 		 195 aa  41.2  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  37.1 
 
 		 198 aa  41.2  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  35.48 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0937  electron transport complex protein RnfB  36.51 
 
 		 192 aa  40.8  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  35.48 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  35.48 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  35.48 
 
 		 193 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  35.48 
 
 		 199 aa  40.8  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0655  putative PAS/PAC sensor protein  35.06 
 
 		 580 aa  40.8  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>